倉庫の大掃除中にアルトサックスを見つけた敷浪。「おめでとう」も素直に言えないことに思い悩む彼女は、ジャズを通じて想いを伝えるため、アルトサックスに挑戦してみることに――。

涼宮ハルヒの課した試練を乗り越えて、SOS団に入団を果たした渡橘ヤスミは、何かとキョンに絡んでくる。佐々木を新たな神にしようと画策する未来人、宇宙人、超能力者集団から呼び出しを受ける。分裂したキョン、それぞれの運命やいかに――。